云谷校区位于杭州市西湖区紫金港科技城云谷地块，规划总用地面积1495亩。启动区一期工程于2018年4月3日开工，2019年4月3日全面开工。全封顶项目一期建设用地635亩，总建筑面积45.6万平方米，共36栋。包括以教学科研为中心的学术圈、学术会堂、行政楼、师生服务中心、教师活动中心、学术交流中心、实验动物中心、3个食堂、25栋师生公寓楼。