蚁后的卵通常不会产在棉花上。蚁后一般会选择安全的地方来产卵，例如蚁巢内部或者植物根部。至于为什么不会选择棉花，可能是因为棉花表面不够平坦，不利于蚁卵的孵化和幼虫的滋生。此外，棉花可能存在化学物质或有毒气体，对蚁卵产生不良影响。

因此，如果在棉花上发现了蚂蚁的卵，请及时采取措施清除，避免蚁卵对棉花的破坏和对作物的影响。